为什么选择高级(Premium)方案?

超过一半的人目前选择了高级方案

在Hiro 诊所,有高级方案和非高级方案。它们的区别在于是否使用高精度的Medicover方法。NIPT有多种方式,其精度各不相同。特别是对于最近开发的微小缺失综合症(指定难病检查)等小缺失的检测,需要Medicover技术。Hiro 诊所与合作的东京卫生检验所共同验证检测结果。

高级非高级
检测方法Medicover方法Illumina方法
检测深度100倍0.3倍
检测精度最高0.5Mb7Mb
SNP检测(超过15万)可能不可能
FF的准确性优(使用SNP)一般
与高级方案的比较。

两者之间最主要的区别在于测序时的读取深度。以与DiGeorge综合症相关的部分为例,顶部是高级方案,底部是基本方案。蓝色的纵轴越高,读取深度越深。Illumina方法在任何位置的读取深度基本相同,因此无法获得更深的深度。由于试剂的量相同,广泛读取时会导致深度变浅。

因此,基本方案对于大小为7Mb的部分缺失和重复没有问题,但对于更小的缺失就比较困难。关于7Mb,可能不太容易理解。下面附上一个柱状图,其中21号染色体的大小为46Mb。即使Illumina方法的检测深度为0.3倍,检测21、18和13号染色体也没有问题。

然而,使用这种技术无法捕捉微小缺失。对于最小且最常见的DiGeorge综合症(指定难病203),超过90%的缺失小于3Mb。Illumina方法无法检测到这些缺失。国外进行的微小缺失综合症检测(使用Illumina检测)采用的是这种技术。

另一个页面中也有说明,在Illumina的国外检测中,FF(胎儿比例)低于10%的阳性结果会变为阴性

约半数的病例中,FF低于10%。

此外,基础类型的FF可能无法正确显示。如果这一点无法准确检测,结果就会出现偏差。Illumina通过胎儿cfDNA长度的差异来统计估算FF,而Medicover方法则使用SNP进行测量。SNP提供个体独特的遗传信息,通过测量从父亲遗传的胎儿DNA,可以准确检测FF。然而,准确读取需要至少30倍以上的深度。因此,Medicover方法会缩小读取范围以获得更深的读取。接下来,我将展示在东京卫生检验所测量的两者的FF图表。这表明在同一患者中,Illumina方法和Medicover方法的差异有多大。

如果两者相同,结果应该接近红线,但实际上存在一定的变异。相关系数 rrr 越接近1,表示两者越相似,但在这里的值为0.83,说明精度并不完美。

准确读取FF意味着区分胎儿和母亲的基因。使用这种技术,双胎的准确性大大提高。即使在超声波检查中只显示一个胎儿,可能仍存在“消失双胎”现象(消失双胎是指原本有两个胎儿,但一个消失的状态)。通过NIPT检测,基因信息有时会诊断出消失双胎。在进行超声检查时,第二个胎儿可能已经变得太小而无法看见,而基因检测也会受到影响。然而,即使在这种情况下,高级方案仍然可以检测到。

那么,Medicover方法是否完美呢?并不是,虽然读取深度很高,但范围较窄。

因此,如果能将两者结合起来,许多盲点将被消除。为此,我们开发了在高级方案中的FM和GM方案。通过组合这两者,可以实现准确且广泛的检测。下面的图中,红色区域表示GM方案,绿色区域表示FM方案。这次不详细讨论常染色体隐性基因检测(+),但这也是Medicover检测的一部分。

FM方案覆盖几乎所有领域,而GM计划则专注于生存时间较长的病例。通过采用这两种方案的高级选项,几乎可以进行NIPT所能检测到的所有检查。