この記事の概要
SNPを用いた尤度比の計算方法について解説します。遺伝子データを基に親子関係や血縁関係の確率を高めるための基礎知識を学びましょう。
SNPを用いた尤度比の求め方は、遺伝子型の一致確率を計算し、それを用いて特定の仮説（例えば、ある人が特定の親子関係にあるという仮説）に対する尤度を算出します。具体的には、以下のステップを行います。
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SNPデータ収集: 親子候補のDNAからSNPデータを収集します。
一致確率の計算: 親子候補間のSNP一致確率を計算します。
尤度比計算: 親子関係仮説と非親子関係仮説の尤度を比較して尤度比を求めます。
例えば、SNPが一致する確率をp、一致しない確率をqとすると、尤度比（LR）はp/qで表されます。
ここでは、具体的な例を挙げて説明します。
仮定:
SNP Aのアリル: 親が「AA」、子が「AA」とする。
母集団におけるアリルAの頻度:
1. 親子関係がある場合の尤度:
親が「AA」の場合、子も「AA」である確率は1です。
2.親子関係がない場合の尤度:
子が「AA」である確率は、アリルAが母集団でどの程度一般的かに依存します。
3. 尤度比（LR）の計算:
この尤度比100は、親子関係がある仮説が、親子関係がない仮説に対して100倍も支持されることを示しています。
複数のSNPを使用する場合、それぞれのSNPについて同様の計算を行い、それらの尤度比を掛け合わせて最終的な尤度比を求めます。
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