本文摘要
在 MiniSeq 上难以读取 STR（短串联重复序列）有几个原因：STR 是重复序列，特别用于法医和亲子鉴定，通常由 2 到 6 个碱基对重复序列组成，位于基因组的特定位置。有几个因素会影响这种分析的准确性：MiSeq 可以读取多达 600 bps 的读数。这使其成为 STR 分析的理想选择。下一代测序仪有多种类型。
其他公司不支持 STR，因为它们是 MiniSeq（小型测序仪）。
主要原因是
- 读数长度限制：
MiniSeq 支持相对较短的读数长度（测序过程中读取的 DNA 片段长度）；STR 分析可能需要较长的读数，而较短的读数可能难以分析重复序列的确切数量和顺序。短读数难以分析重复序列的确切数量和顺序。短读数可能无法准确读取序列，尤其是在 STR 区域较长的情况下。 - 错误率：
STR 是高度重复的序列，而 NGS（下一代测序）技术对于重复序列尤其容易出错；MiniSeq 专为靶向测序而设计，对序列准确性要求极高。因此，在需要对重复序列进行分析的 STR 分析中，错误率可能会增加。 - 分析所需的特殊文库制备：
STR 分析通常需要专门的文库制备和分析工具。STR 分析所需的制备和分析软件可能不完全支持。 - 数据输出的局限性：
与 MiSeq 等其他型号相比，MiniSeq 的数据吞吐量较低，因此很难生成足够的数据来覆盖大量重复序列或复杂的 STR 区域。因此，MiniSeq 的性能可能不够理想。
备选提案：
要获得准确的 STR 读数，MiSeq 或功能更强的测序仪更为合适。这些型号的测序仪读取长度更长，纠错能力更强，可以获取 STR 分析所需的高精度数据。MiSeq 的读长可达 600 bps，而 MiniSeq 读长只有 300 bps，只能计算 SNP。许多使用 MiniSeq 的实验室无法支持 STR。东京卫生实验室是唯一一家能够支持 STR 的实验室。
简而言之，MiniSeq 是一种适用于相对小规模靶向测序的仪器，可能无法满足 STR 分析等高级要求。
