如何利用 SNP 获得似然比

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本文摘要

学习如何利用 SNP 计算似然比。学习根据基因数据提高亲子关系和亲属关系概率的基础知识。

要利用 SNPs 计算似然比,首先要计算基因型匹配的概率,然后再利用该概率计算特定假设(如某人具有特定亲子关系的假设)的似然比。具体来说,需要执行以下步骤。

SNP 数据收集:从亲子候选者的 DNA 中收集 SNP 数据。
匹配概率计算:计算亲子候选者之间的 SNP 匹配概率。
似然比计算:通过比较亲子关系假设和非亲子关系假设的似然性,计算似然比。

例如,如果 SNP 匹配的概率为 p,不匹配的概率为 q,则似然比(LR)表示为 p/q。

在此举例说明。

假设:SNP A 的等位基因:父 “AA”,子 “AA”。
等位基因 A 在人群中的频率:.

1. 存在亲子关系的可能性:。

如果父母是 “AA”,那么子女也是 “AA “的概率就是 1。

2. 没有亲子关系的可能性:.

孩子是 “AA “的概率取决于等位基因 A 在人群中的常见程度。

3. 计算似然比 (LR):

似然比为 100,表示有亲子关系的假设比没有亲子关系的假设要成立 100 倍。

如果使用了多个 SNP,则要对每个 SNP 进行类似的计算,然后将它们的似然比相乘,得出最终的似然比。

单击此处了解如何使用 STR 获得似然比。

文章监修者


冈 博史博士

CAP实验室总监

毕业于庆应义塾大学医学部

医学博士

医生