利用短串联重复序列（STR）计算似然比（LR）的方法主要用于亲子鉴定和法医学，以检验特定假设（如某人是孩子的父亲）。
什么是似然比 (LR)？
似然比（LR）是根据两个假设来衡量一个遗传证据的强度。它通常根据以下两个假设来计算
- 假设 1 (H1)：受访者 A 是孩子的亲生父亲。
- 假设 2 (H2)：受访者 A 不是孩子的亲生父亲，而是一个没有血缘关系的人。
使用 STR 计算似然比。
STR比较特定基因座上重复序列（等位基因）的数量。在亲子鉴定中，将孩子的基因座（等位基因）与受测者的基因座（等位基因）进行比较，以评估两者的一致程度。似然比的计算步骤如下
1. 假设 1 (H1) 的可能性计算
H1：如果受访者 A 是孩子的父亲 如果受访者 A 是孩子的父亲，那么孩子从父亲那里遗传到特定等位基因的概率是1/2。这是因为孩子继承父亲两个等位基因之一的概率是 1/2。
2. 假设 2 (H2) 的可能性计算
H2：如果受访者 A 不是孩子的父亲 在这种情况下，孩子的等位基因与非亲缘个体匹配的概率取决于该等位基因在人群中的出现 频率。这可以从基因数据库和其他来源估算，并使用该等位基因在人群中出现的频率（如 0.05）。
3. 计算似然比
似然比 (LR) 的计算方法是，在两种假设下获得的证据的似然比。
- H1 的可能性（如果他是父亲） = 1/2
- H2 的可能性（如果不是父亲） = 等位基因频率（如 p）
因此，LR 的计算方法如下
对每个位点进行计算，然后将所有位点的 LR 相乘，得到最终的似然比。
4. 计算多个位点的 LRs
STR 分析通常使用多个基因位点。例如，在 13-20 个位点上计算 LR，然后乘以各自的 LR，得出总的 LR。
5. LR 的解释。
- LR 大于 1：表示受访者 A 是父亲的假设（H1）比他不是父亲的假设（H2）更成立。例如，如果 LR = 1000，则 “他是父亲 “的假设比 “他不是父亲 “的假设更成立 1000 倍。
- 如果 LR 小于 1：表明他不是父亲（H2）的假设可能性更大。
例
假设在一个位点上，孩子和受试者 A 的等位基因匹配，且该等位基因在人群中的频率为0.05。
- H1的可能性（如果他是父亲）= 1/2
- H2的可能性（如果不是父亲）= 0.05
在这种情况下，LR 如下。
仅从这个位置来看，受访者 A 是父亲的概率比他不是父亲的概率高十倍。
摘要
- 带有 STR 的似然比 (LR) 是一种在 DNA 鉴定中比较基于两种假设的证据并量化哪种假设更有可能的方法。
- 计算每个位点的 LR，最后乘以所有位点的 LR，得出总体 LR。
- LR 值大于等于 1 表明受访者更有可能是父亲，而 LR 值小于 1 则表明受访者更有可能不是父亲。
这种方法提高了亲子关系评估和个人鉴定的准确性，使决策建立在科学证据的基础上。
